Ami est mort. Tokyo est libérée. Mais la dernière page du nouveau cahier de prédictions révèle un terrible message. Une dernière menace posthume laissée par Ami.
Pour découvrir ce dont il s’agit et tenter de sauver une nouvelle fois l’humanité, Kenji replonge dans le passé grâce au simulateur de réalité virtuelle d’Ami-land.